Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms