Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OFD1O75665 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OFD1O75665 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OFD1O75665 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OFD1O75665 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OFD1O75665 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OFD1O75665 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OFD1O75665 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OFD1O75665 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms