Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR1O43759 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR1O43759 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms