Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNAB3O43448 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNAB3O43448 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms