Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms