Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H7C0C1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C0C1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C0C1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C0C1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C0C1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H7C0C1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H7C0C1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H7C0C1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H7C0C1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H7C0C1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H7C0C1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H7C0C1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H7C0C1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms