Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms