Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms