Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCTN4Q9UJW0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCTN4Q9UJW0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms