Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ORC3Q9UBD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ORC3Q9UBD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms