Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D2Q9NY47 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms