Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms