Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XAB2Q9HCS7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XAB2Q9HCS7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms