Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAIPQ9BWF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAIPQ9BWF2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms