Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYCBPQ99417 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYCBPQ99417 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms