Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms