Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L4Q8WXT5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L4Q8WXT5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms