Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUFY2Q8WXA3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms