Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms