Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 LTBP3-207ENST00000526927 2750 ntTSL 218.03■□□□□ 0.481e-7■■■□□ 18.5
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AGGF1Q8N302 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-8■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.123e-8■■■□□ 18.1
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AGGF1Q8N302 TMEM116-209ENST00000550020 572 ntTSL 49.24□□□□□ -0.936e-8■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 TMEM116-214ENST00000551297 660 ntTSL 37.94□□□□□ -1.146e-8■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 TMEM116-212ENST00000550800 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.59□□□□□ -1.516e-8■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 TMEM116-210ENST00000550037 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.18□□□□□ -1.746e-8■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.65e-8■■■□□ 18.1
AGGF1Q8N302 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-11■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.942e-11■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.496e-11■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.696e-11■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.33e-7■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-8■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.18e-8■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 214.38□□□□□ -0.118e-8■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 318■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.032e-6■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 18
AGGF1Q8N302 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 215.78■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 18
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