Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC105Q8IYK2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC105Q8IYK2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC105Q8IYK2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC105Q8IYK2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms