Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLF2Q8IX21 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms