Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDXQ7Z353 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms