Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms