Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L3Q6VB84 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms