Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCLAT1Q6UWP7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCLAT1Q6UWP7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms