Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM4Q6P4Q7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms