Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms