Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4orf17Q53FE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4orf17Q53FE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms