Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO1Q147U7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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