Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2V1Q13404 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2V1Q13404 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms