Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FMODQ06828 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FMODQ06828 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FMODQ06828 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FMODQ06828 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms