Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms