Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms