Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC1P78348 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms