Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL23P62829 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL23P62829 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL23P62829 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL23P62829 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms