Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOBP62745 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOBP62745 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms