Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP107P57740 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUP107P57740 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP107P57740 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUP107P57740 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUP107P57740 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUP107P57740 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUP107P57740 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms