Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB25P57735 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB25P57735 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms