Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4AP20338 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms