Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms