Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF4P15884 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF4P15884 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF4P15884 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF4P15884 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF4P15884 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCF4P15884 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF4P15884 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF4P15884 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF4P15884 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms