Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKAP3O75969 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKAP3O75969 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms