Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNKO75909 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNKO75909 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNKO75909 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNKO75909 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms