Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PES1O00541 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PES1O00541 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PES1O00541 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PES1O00541 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PES1O00541 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PES1O00541 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PES1O00541 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PES1O00541 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PES1O00541 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PES1O00541 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PES1O00541 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PES1O00541 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PES1O00541 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PES1O00541 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PES1O00541 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PES1O00541 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PES1O00541 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PES1O00541 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms