Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMX3A6NHT5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMX3A6NHT5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms