Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEIS3P1A6NDR6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MEIS3P1A6NDR6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms