Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 EIF2A-210ENST00000474505 1010 ntTSL 28.47□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 EIF2A-216ENST00000494558 710 ntTSL 58.47□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 TIAL1-212ENST00000495821 372 ntTSL 28.4□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 LARS-214ENST00000512412 575 ntTSL 58.06□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 TIAL1-202ENST00000369087 1566 ntTSL 27.95□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 AL034397.3-201ENST00000618234 1690 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-214ENST00000524301 561 ntTSL 47.34□□□□□ -1.234e-12■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 RNMT-210ENST00000593007 811 ntTSL 47.32□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 TAF1-214ENST00000478305 614 ntTSL 36.22□□□□□ -1.414e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 EIF2A-215ENST00000490505 568 ntTSL 56.17□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 EIF2A-207ENST00000469331 553 ntTSL 25.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.534e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 IFNAR2-209ENST00000443073 841 ntTSL 55.42□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 34.2
UTP3Q9NQZ2 KDM3A-204ENST00000427678 565 ntTSL 215.93■□□□□ 0.147e-9■■■■■ 34.1
UTP3Q9NQZ2 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 34.1
UTP3Q9NQZ2 FXR1-222ENST00000498658 683 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 34.1
UTP3Q9NQZ2 FXR1-212ENST00000476672 976 ntTSL 27.82□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 34.1
UTP3Q9NQZ2 XPO1-211ENST00000451765 643 ntTSL 316.91■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 316.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 RSU1-204ENST00000464074 1141 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 RSU1-202ENST00000377911 955 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 RSU1-205ENST00000602389 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 210.09□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 215.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 34
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-211ENST00000637918 1027 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 33.9
UTP3Q9NQZ2 U2AF2-207ENST00000592867 447 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 33.9
UTP3Q9NQZ2 EIF4B-206ENST00000549592 1901 ntTSL 212.01□□□□□ -0.496e-9■■■■■ 33.9
UTP3Q9NQZ2 SRGN-201ENST00000242465 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-11■■■■■ 33.9
UTP3Q9NQZ2 SRGN-202ENST00000462445 802 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-11■■■■■ 33.9
UTP3Q9NQZ2 LMNA-209ENST00000459904 916 ntTSL 216.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 33.9
UTP3Q9NQZ2 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 511.09□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 CKAP5-204ENST00000525896 832 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 ZRANB2-206ENST00000487510 579 ntTSL 211.08□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 ZRANB2-205ENST00000479947 470 ntTSL 29.27□□□□□ -0.937e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 ZRANB2-204ENST00000477096 3677 ntTSL 1 (best)2.95□□□□□ -1.947e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 519.5■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 33.8
UTP3Q9NQZ2 SAE1-205ENST00000594144 723 ntTSL 315.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 SAE1-210ENST00000600706 744 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 PKP4-211ENST00000481115 884 ntTSL 58.12□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.215e-18■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.435e-18■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 316.45■□□□□ 0.225e-18■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 312.51□□□□□ -0.415e-18■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 211.79□□□□□ -0.525e-18■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 211.79□□□□□ -0.525e-18■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 512.46□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 MSH5-209ENST00000450148 1000 ntTSL 513.11□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 MSH5-213ENST00000468136 690 ntTSL 210.83□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 SREBF2-203ENST00000435061 770 ntTSL 318.25■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 GLUL-205ENST00000461447 689 ntTSL 212.07□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 33.7
UTP3Q9NQZ2 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 530.43■■■□□ 2.462e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.192e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.022e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 325.02■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ELMSAN1-208ENST00000476562 5314 ntTSL 223.46■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 323.43■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC25-202ENST00000447096 2498 ntTSL 1 (best)23.25■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 USP21-204ENST00000479344 709 ntTSL 222.43■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ANO8-203ENST00000600711 678 ntTSL 322.37■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 SMC6-210ENST00000621152 500 ntTSL 321.82■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC25-203ENST00000463589 2572 ntTSL 521.12■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 220.71■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 33.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3552.8 ms