Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQE9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQE9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQE9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQE9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms