Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms